Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
C10orf55Q5SWW7 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms