Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 S1PR3-202ENST00000375846 8505 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 DRP2-203ENST00000402866 7018 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TRANK1-201ENST00000429976 10481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 EPHB2-204ENST00000400191 10816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 MYEF2-202ENST00000324324 10360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC008938.1-201ENST00000566929 6510 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 VPS8-227ENST00000625842 4969 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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