Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CNGB1Q14028 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CNGB1Q14028 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CNGB1Q14028 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CNGB1Q14028 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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