Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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