Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms