Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCSER1Q9C0I3 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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