Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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