Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms