Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms