| RUNX3 | Q13761 | TRGV5P-201 | ENST00000419915 | 354 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FABP7P2-201 | ENST00000429946 | 379 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL035416.1-201 | ENST00000443012 | 767 nt | TSL 2 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FLJ27354-202 | ENST00000443562 | 770 nt | TSL 3 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z80107.2-201 | ENST00000445127 | 392 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092647.2-201 | ENST00000452998 | 253 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL37-204 | ENST00000508493 | 553 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MSC-AS1-205 | ENST00000519068 | 569 nt | TSL 3 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCNPP1-201 | ENST00000552501 | 511 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009063.2-203 | ENST00000567860 | 745 nt | TSL 2 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3934-201 | ENST00000579806 | 107 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007448.2-201 | ENST00000583452 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC243960.1-203 | ENST00000595395 | 599 nt | TSL 4 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010531.5-201 | ENST00000602779 | 450 nt | TSL 3 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353729.2-201 | ENST00000605859 | 1249 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SHMT1-211 | ENST00000618902 | 378 nt | TSL 5 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BDNF-210 | ENST00000438929 | 4059 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TGFBR1-208 | ENST00000550253 | 1538 nt | TSL 2 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PANDAR-201 | ENST00000629595 | 1506 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC28A3-201 | ENST00000376238 | 4887 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HCFC2P1-201 | ENST00000392864 | 1592 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZSCAN4-201 | ENST00000318203 | 2246 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIAA1841-205 | ENST00000453873 | 4294 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MLH3-202 | ENST00000380968 | 7819 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM170B-AS1-203 | ENST00000442525 | 2000 nt | TSL 2 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GPX8-201 | ENST00000296734 | 3245 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AK3-201 | ENST00000359883 | 1536 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMED3-202 | ENST00000424155 | 16555 nt | TSL 3 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AFF2-201 | ENST00000286437 | 12280 nt | TSL 2 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAS-203 | ENST00000355279 | 983 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HSPB11-202 | ENST00000371376 | 765 nt | TSL 3 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DBIP1-201 | ENST00000401435 | 260 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPA2P2-201 | ENST00000419698 | 796 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC244394.2-201 | ENST00000425109 | 735 nt | TSL 5 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354863.1-202 | ENST00000431695 | 494 nt | TSL 5 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC058823.1-201 | ENST00000485315 | 474 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02492-201 | ENST00000502952 | 564 nt | TSL 5 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF4E-204 | ENST00000504432 | 1132 nt | TSL 5 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IGHVII-44-2-201 | ENST00000517728 | 250 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5AZ1P-201 | ENST00000527448 | 943 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025423.4-201 | ENST00000553141 | 785 nt | TSL 3 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HNRNPCP1-201 | ENST00000556181 | 766 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007066.2-202 | ENST00000566531 | 914 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087501.4-201 | ENST00000574460 | 235 nt | TSL 5 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC107926.1-201 | ENST00000581673 | 621 nt | TSL 3 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4480-201 | ENST00000582492 | 71 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC131274.1-201 | ENST00000582507 | 254 nt | TSL 3 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF230-204 | ENST00000585632 | 579 nt | TSL 2 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR6820-201 | ENST00000611508 | 62 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF3FP1-201 | ENST00000613970 | 806 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCL14-204 | ENST00000622526 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087632.1-216 | ENST00000625619 | 487 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TEX41-254 | ENST00000626394 | 423 nt | TSL 5 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SRGAP1-201 | ENST00000355086 | 23331 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RRP15-201 | ENST00000366932 | 7771 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024337.2-201 | ENST00000616608 | 2797 nt | TSL 5 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RIC3-202 | ENST00000335425 | 5223 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BPIFC-201 | ENST00000300399 | 1980 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIAA2012-204 | ENST00000498697 | 3772 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCDH15-215 | ENST00000409834 | 5401 nt | TSL 5 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FP236241.1-201 | ENST00000623374 | 7632 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CU633967.1-211 | ENST00000624444 | 7628 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM135A-202 | ENST00000361499 | 5042 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099673.1-201 | ENST00000452199 | 2296 nt | TSL 2 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | THAP12P4-201 | ENST00000528321 | 2266 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL606516.1-201 | ENST00000455438 | 1861 nt | TSL 2 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092747.4-201 | ENST00000620519 | 1861 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8D4-201 | ENST00000321355 | 1331 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF347-202 | ENST00000452676 | 4553 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF891-201 | ENST00000537226 | 15455 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTPRO-204 | ENST00000445537 | 4062 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NEMF-201 | ENST00000298310 | 6234 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM205A-201 | ENST00000378788 | 4225 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADGRF5-201 | ENST00000265417 | 5668 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DBT-202 | ENST00000370132 | 10799 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01361-202 | ENST00000452834 | 1526 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | G3BP1-202 | ENST00000394123 | 10240 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR7G2-201 | ENST00000305456 | 1038 nt | APPRIS P2 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNURFL-201 | ENST00000309296 | 343 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP123-201 | ENST00000363244 | 119 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPIL1-201 | ENST00000373699 | 1739 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA51.8-201 | ENST00000384234 | 132 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD56.6-201 | ENST00000384569 | 71 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRBV24-1-201 | ENST00000390397 | 381 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL035419.1-201 | ENST00000397037 | 564 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL008723.2-201 | ENST00000426354 | 562 nt | TSL 4 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARPP21-215 | ENST00000432682 | 1015 nt | TSL 5 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KATNBL1P2-201 | ENST00000433311 | 835 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL137076.1-201 | ENST00000441046 | 551 nt | TSL 2 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | H2AFZP6-201 | ENST00000444403 | 394 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL160271.1-201 | ENST00000444708 | 829 nt | TSL 3 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003774.4-201 | ENST00000447028 | 672 nt | TSL 2 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCNMB2-AS1-205 | ENST00000451742 | 844 nt | TSL 4 BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PSAT1P4-201 | ENST00000466500 | 526 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097484.1-201 | ENST00000471148 | 389 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092593.2-201 | ENST00000513866 | 913 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBE2Q2P10-201 | ENST00000514854 | 900 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARL6IP1P3-201 | ENST00000524544 | 560 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF4EP5-201 | ENST00000528228 | 640 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BRD9P1-201 | ENST00000529855 | 560 nt | BASIC | 5.44 | □□□□□ -1.54 | | |