Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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HOXD10P28358 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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HOXD10P28358 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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HOXD10P28358 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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HOXD10P28358 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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