Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms