Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ZNF548Q8NEK5 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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