Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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