Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
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