Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms