Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ODC1P11926 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ODC1P11926 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ODC1P11926 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ODC1P11926 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ODC1P11926 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ODC1P11926 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ODC1P11926 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ODC1P11926 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ODC1P11926 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.6 ms