Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms