Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Top3bQ9Z321 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms