Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt27Q9Z320 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms