Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms