Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn6Q9Z262 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn6Q9Z262 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cldn6Q9Z262 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms