Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccne2Q9Z238 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms