Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms