Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VarsQ9Z1Q9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms