Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Ddx39bQ9Z1N5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms