Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Katna1Q9WV86 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Katna1Q9WV86 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms