Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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