Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms