Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms