Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms