Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms