Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms