Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed2Q9R0Q3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms