Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo1Q9QZ11 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms