Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms