Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChmQ9QXG2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms