Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer2Q9QWW1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms