Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp39a1Q9JKJ9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms