Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms