Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM5

Yipf7, Protein YIPF7, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf7Q9JIM5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Yipf7Q9JIM5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Yipf7Q9JIM5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Yipf7Q9JIM5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Yipf7Q9JIM5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Yipf7Q9JIM5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yipf7Q9JIM5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yipf7Q9JIM5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms