Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pus3Q9JI38 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms