Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn19Q9ET38 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms