Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim39Q9ESN2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms