Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ush1cQ9ES64 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ush1cQ9ES64 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms