Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SelenofQ9ERR7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SelenofQ9ERR7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms