Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms