Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snap29Q9ERB0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snap29Q9ERB0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Snap29Q9ERB0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snap29Q9ERB0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snap29Q9ERB0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snap29Q9ERB0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snap29Q9ERB0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snap29Q9ERB0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snap29Q9ERB0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snap29Q9ERB0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Snap29Q9ERB0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms