Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndst3Q9EQH7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms