Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf8Q9EQH4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf8Q9EQH4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf8Q9EQH4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf8Q9EQH4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf8Q9EQH4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Taf8Q9EQH4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Taf8Q9EQH4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms